Danau Toba terbentuk akibat letusan gunung berapi super (supervolcano) yang terjadi sekitar 74.000 tahun lalu. Letusan ini merupakan salah satu letusan terbesar dalam sejarah bumi yang meninggalkan kaldera raksasa yang kini dikenal sebagai Danau Toba. Material vulkanik dari letusan ini tersebar hingga ke berbagai belahan dunia, termasuk India dan Afrika.

Kawasan Danau Toba kini diakui UNESCO sebagai Global Geopark pada tahun 2020. Pengakuan ini diberikan karena nilai geologi yang luar biasa, keanekaragaman hayati, serta warisan budaya Batak yang masih terjaga hingga saat ini.